证明一个分子具有特定功能表型的方法,通常通过分子操作,人为改变分子表达,观察表型变化。主要分为两种方式:
第一种为“获得功能”(gain of function),如过表达(over expression),即增加目标分子的表达量,观察其对生物体或细胞的影响;
第二种为“丧失功能”(loss of function),如沉默(silence)或敲除,针对低表达的基因,通过抑制其表达,研究其功能。
在研究疾病相关基因时,若基因在疾病中高表达,通常采用抑制和下调手段,反之,对于低表达基因,则采取上调和过表达方法。这种一正一反的研究逻辑,是证明分子功能表型的有效途径。
生物系统复杂多样,不同细胞株中基因表达存在差异。在研究特定分子功能时,需首先检测其在不同细胞株中的表达水平与本底状态,然后在高表达的细胞株中应用沉默技术,低表达细胞株则采用过表达策略。
实现分子过表达的方法有质粒与病毒两种。质粒是一种包含结构元件的环状DNA分子,可将特定序列的DNA基因表达出来。通过脂质体转染技术,将质粒导入细胞,实现基因表达。这一过程类似于利用卡车运输货物,但面对恶劣条件时,需采用更坚固的运输方式,即病毒介导的基因传递,尤其适用于难以转染的细胞,如神经细胞与干细胞。
沉默分子的方法主要为RNA干扰技术(RNAi),通过脂质体将21个碱基的sRNA转染至细胞,高效且特异地阻断目标基因的表达。sRNA与细胞内蛋白复合体结合,识别互补配对的mRNA,利用核酸内切酶活性将其切割降解,达到沉默目的。
设计sRNA时,可参考基因的多个候选序列,通常选择3条,以提高实验效果。RNAi实验中,需预先筛选有效sRNA,确保目标基因被高效沉默。
RNAi技术虽强大,但未来5年可能被CRISPR技术取代。CRISPR技术通过设计指导RNA(gRNA)与辅助蛋白Cas9共同作用,实现基因敲除。与RNAi相比,CRISPR技术操作更为便捷,只需额外导入Cas9蛋白,且该蛋白在细胞中预先制备,便于重复使用。
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