这表明你的发票系统已被主管税局设定为单张发票不含税金额最高为999.99元，即限额为千元版。这意味着在开具发票时，金额不能超过这一上限。
如果你的业务需求超过了这一限额，可以向主管税局申请调整限额。这需要你准备相关的业务证明材料，例如业务规模、业务量等，以证明确实需要更高的限额。
在申请过程中，税务机关可能会进行实地考察，以确保你的业务需求是真实的，并且符合相关法律法规。一旦获得批准，你的发票系统将能够开具更高的不含税金额发票。
需要注意的是，调整发票限额并非一蹴而就的过程，可能需要一定的时间。在此期间，你仍需遵守现有的发票限额规定，确保开具的发票金额在限额之内。
为了更好地管理发票，建议你定期与主管税局沟通，了解最新的政策和要求，以便及时调整你的业务流程，确保合规操作。
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回答时间：2025-01-14 17:06
