转录组（transcriptome）是指细胞在特定生理条件下产生的所有转录产物集合，包含mRNA、lncRNA、small RNA等。本文聚焦于mRNA和lncRNA的分析内容，发现二者分析内容具有相似性。mRNA分析内容包括初级分析和次级分析两大部分。初级分析主要关注mRNA的表达水平、差异表达基因（DEGs）鉴定以及基因本体论（GO）和途径富集分析等。次级分析则进一步探索DEGs的功能和生物学意义，比如通过蛋白质互作网络（PPI）分析或构建转录因子作用网络（TF-Network）来揭示分子调控机制。lncRNA的分析内容同样涵盖初级分析和次级分析。初级分析通常涉及lncRNA的表达特征分析、差异表达lncRNA鉴定以及与DEGs的关联分析等。次级分析侧重于深入理解lncRNA的功能，如通过预测其作用机制（如作为miRNA海绵或参与RNA编辑）和参与的生物学过程（如GO和途径富集）来探索其在细胞生理和病理过程中的作用。在生信科服领域，针对临床肿瘤科研数据分析的需求，与我们合作，微信：usegalaxy，获取专业的技术支持，共同推进科研成果。
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回答时间：2025-03-23 23:01
