网页版ImageJ实用教程:
一、简介 ImageJ.JS:ImageJ实现了移动端使用,通过CheerpJ技术将Java源码编译为WebAssembly和JavaScript,并结合ImJoy插件,为用户提供网页版的ImageJ体验。
二、优势 跨平台访问:适用于手机、平板等移动端设备,以及PC端浏览器,扩展了ImageJ的使用范围。 操作便捷:无需下载ImageJ1或Fiji软件,直接在网页上进行操作。 深度学习支持:直接连接ImJoy插件,支持深度学习功能。
三、使用指南 PC端使用: 使用Chrome、Firefox或Microsoft Edge浏览器直接访问ImageJ.JS的GitHub地址。 如加载较慢,可选择国内镜像进行访问。 移动端使用: 目前仅支持Chrome和Firefox浏览器。 Firefox浏览器需在移动端下载,初次加载时间较长。 平板屏幕大小限制了部分操作,触屏实现可能不便。
四、应用实例 Cellpose细胞分割: 功能:实现网页端实时自动细胞分割,支持获取每个细胞Mask和ROI。 步骤: 1. 打开本地图像。 2. 转换为8bit图像。 3. 设置Cellpose插件参数。 4. 使用Cellpose进行分割。 5. 保存结果到本地。 手动计数: 功能:在移动端运行,如在手机上使用Multipoint工具进行计数。 步骤:通过Analyze > Measure获得汇总结果。
五、注意事项 ImageJ.JS目前仍在开发阶段,未来将添加更多实用功能和插件。 如遇到问题,欢迎通过GitHub提交Issues,以报告bug或提出建议。
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